Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP19Q99542 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms