Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YME1L1Q96TA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YME1L1Q96TA2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms