Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN18Q96SJ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN18Q96SJ8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms