Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCC1Q96RQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCC1Q96RQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms