Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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