Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms