Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms