Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms