Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRRFQ96E11 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRRFQ96E11 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRRFQ96E11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRRFQ96E11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms