Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC8Q96B26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC8Q96B26 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms