Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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RABGGTAQ92696 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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