Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSKUQ8WUA8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms