Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C2Q8WUA4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C2Q8WUA4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms