Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IL1Q8TBN0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms