Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms