Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM20Q8N5G0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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