Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCL2Q8N4E4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms