Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00518Q8N0U6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00518Q8N0U6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms