Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC6Q8IVU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC6Q8IVU3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms