Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT28Q7Z3Y7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT28Q7Z3Y7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms