Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM5Q71RC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms