Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA2Q6ZNG9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA2Q6ZNG9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA2Q6ZNG9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRBA2Q6ZNG9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRBA2Q6ZNG9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms