Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VITQ6UXI7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms