Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1Q6PKG0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms