Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC174Q6PII3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms