Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A4Q6P1M0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC27A4Q6P1M0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms