Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
OTUD7BQ6GQQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD7BQ6GQQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms