Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX8Q68G74 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms