Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF39

MFSD4B, Sodium-dependent glucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4BQ5TF39 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MFSD4BQ5TF39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD4BQ5TF39 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms