Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATAD3CQ5T2N8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms