Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN11Q5T124 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms