Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHSL1Q5SYE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHSL1Q5SYE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms