Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LACTB2Q53H82 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms