Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF394Q53GI3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF394Q53GI3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms