Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
GPAT3Q53EU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPAT3Q53EU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms