Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBK1Q52WX2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms