Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms