Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTHFSDQ2M296 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTHFSDQ2M296 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms