Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q1T7F1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q1T7F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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