Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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