Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4AQ14139 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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