Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDX39BQ13838 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDX39BQ13838 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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