Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SHROOM2Q13796 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
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