Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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