Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC3Q13507 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC3Q13507 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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