Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms