Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 CDC4YFL009W 2340 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RNT1YMR239C 1416 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ASF2YDL197C 1578 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 TSL1YML100W 3297 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MIH1YMR036C 1665 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ATO3YDR384C 828 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SEC4YFL005W 648 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RPS25AYGR027C 327 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 QCR10YHR001W-A 234 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 BIG1YHR101C 1008 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RAD33YML011C 534 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YOR225WYOR225W 330 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SUA7YPR086W 1038 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ESA1YOR244W 1338 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MID1YNL291C 1647 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SSA2YLL024C 1920 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 GPT2YKR067W 2232 nt5.7□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 NUD1YOR373W 2556 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YMR111CYMR111C 1389 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PUF2YPR042C 3228 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SDO1YLR022C 753 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PBI2YNL015W 228 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 TRM112YNR046W 408 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RGS2YOR107W 930 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 CWC27YPL064C 906 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 VPS69YPR087W 321 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 XKS1YGR194C 1803 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RKM3YBR030W 1659 nt5.69□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 BUD7YOR299W 2241 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YJL049WYJL049W 1353 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 QDR3YBR043C 2070 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 STE13YOR219C 2796 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 HPR1YDR138W 2259 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 VMA13YPR036W 1437 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 GEM1YAL048C 1989 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PPR1YLR014C 2715 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YCR013CYCR013C 648 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 IDP1YDL066W 1287 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SPT2YER161C 1002 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 DBP8YHR169W 1296 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YIL175WYIL175W 318 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YKL136WYKL136W 399 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PEP12YOR036W 867 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YBR090CYBR090C 369 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SNU56YDR240C 1479 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 HCM1YCR065W 1695 nt5.68□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MDM34YGL219C 1380 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YPL109CYPL109C 1974 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YTA12YMR089C 2478 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 HSF1YGL073W 2502 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RPA14YDR156W 414 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 EGD2YHR193C 525 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YKT6YKL196C 603 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 NNT1YLR285W 786 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YNL235CYNL235C 432 nt5.67□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SMF2YHR050W 1650 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MNS1YJR131W 1650 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YMR018WYMR018W 1545 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ALD6YPL061W 1503 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RRP42YDL111C 798 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PRM8YGL053W 714 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 APS3YJL024C 585 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MCM22YJR135C 720 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 DCS1YLR270W 1053 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ATP18YML081C-A 180 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YNL181WYNL181W 1224 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YOR053WYOR053W 342 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PHO90YJL198W 2646 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 CDC5YMR001C 2118 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 AMD1YML035C 2433 nt5.66□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 SOF1YLL011W 1470 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 HOP2YGL033W 657 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 CDC43YGL155W 1131 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YHR097CYHR097C 1101 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PRM10YJL108C 1152 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 VPS51YKR020W 495 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RPS9AYPL081W 594 nt5.65□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 GPA2YER020W 1350 nt5.65□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 GDI1YER136W 1356 nt5.65□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 GCD10YNL062C 1437 nt5.65□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 NAM9YNL137C 1461 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 NEL1YHR035W 1893 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 NTH1YDR001C 2256 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 FAT3YKL187C 2253 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 SFB3YHR098C 2790 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 SIF2YBR103W 1608 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 YER175W-AYER175W-A 165 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 GEP5YLR091W 882 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 YBL055CYBL055C 1257 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 YOR186WYOR186W 435 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt5.64□□□□□ -1.51
HDA3Q06623 INA17YPL099C 549 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms