Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELQ04864 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELQ04864 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RELQ04864 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RELQ04864 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELQ04864 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELQ04864 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELQ04864 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELQ04864 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELQ04864 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELQ04864 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELQ04864 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELQ04864 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELQ04864 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms