Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREMQ03060 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREMQ03060 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREMQ03060 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREMQ03060 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREMQ03060 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREMQ03060 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREMQ03060 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREMQ03060 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREMQ03060 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREMQ03060 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREMQ03060 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREMQ03060 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREMQ03060 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREMQ03060 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms