Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX1P83916 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX1P83916 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX1P83916 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX1P83916 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms